第二代试管婴儿主要是直接将精子注入到卵母细胞的胞浆当中，达到辅助怀孕的目的，在临床上使一些男性不孕症的患者达到了怀孕的目的。在临床上主要适合于严重的少精、弱精、精子畸形，另外不可逆的梗阻性无精子症、生精功能障碍、免疫性不孕、体外受精失败的病人，或者精子顶体异常，都可以用第二代试管婴儿技术来达到怀孕的目的。

在临床上二代试管婴儿也存在一定的缺陷，比如因为违背了自然受精的生物法则，就存在比较大的遗传风险，所以在做二代试管婴儿之前要了解基本的状况。